Protein–RNA interactions for Protein: P58321

Uchl4, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase isozyme L4, mousemouse

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uchl4P58321 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Uchl4P58321 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Uchl4P58321 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Uchl4P58321 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms