Protein–RNA interactions for Protein: P50711

Defa13, Alpha-defensin 13, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa13P50711 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Plppr3-201ENSMUST00000092325 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa13P50711 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa13P50711 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Defa13P50711 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Defa13P50711 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa13P50711 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa13P50711 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa13P50711 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa13P50711 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Defa13P50711 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Defa13P50711 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa13P50711 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa13P50711 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa13P50711 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa13P50711 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa13P50711 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa13P50711 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa13P50711 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa13P50711 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Defa13P50711 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Defa13P50711 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Defa13P50711 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa13P50711 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa13P50711 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa13P50711 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa13P50711 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa13P50711 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa13P50711 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Defa13P50711 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa13P50711 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Defa13P50711 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Defa13P50711 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms