Protein–RNA interactions for Protein: P50481

Lhx3, LIM/homeobox protein Lhx3, mousemouse

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx3P50481 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Lhx3P50481 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lhx3P50481 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lhx3P50481 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lhx3P50481 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Lhx3P50481 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Lhx3P50481 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Lhx3P50481 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lhx3P50481 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lhx3P50481 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lhx3P50481 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Lhx3P50481 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Lhx3P50481 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lhx3P50481 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lhx3P50481 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Lhx3P50481 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lhx3P50481 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lhx3P50481 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Lhx3P50481 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Lhx3P50481 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx3P50481 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx3P50481 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx3P50481 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx3P50481 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx3P50481 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx3P50481 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Lhx3P50481 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx3P50481 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx3P50481 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx3P50481 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx3P50481 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx3P50481 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx3P50481 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx3P50481 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx3P50481 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Lhx3P50481 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx3P50481 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx3P50481 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx3P50481 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx3P50481 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx3P50481 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx3P50481 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx3P50481 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx3P50481 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lhx3P50481 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lhx3P50481 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lhx3P50481 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms