Protein–RNA interactions for Protein: P47856

Gfpt1, Glutamine--fructose-6-phosphate aminotransferase [isomerizing] 1, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gfpt1P47856 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gfpt1P47856 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gfpt1P47856 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gfpt1P47856 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gfpt1P47856 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gfpt1P47856 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfpt1P47856 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfpt1P47856 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfpt1P47856 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gfpt1P47856 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gfpt1P47856 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms