Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms