Protein–RNA interactions for Protein: P40223

Csf3r, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, mousemouse

Predictions only

Length 837 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csf3rP40223 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Csf3rP40223 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Csf3rP40223 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms