Protein–RNA interactions for Protein: P31532

Saa4, Serum amyloid A-4 protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saa4P31532 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Saa4P31532 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa4P31532 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa4P31532 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa4P31532 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa4P31532 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa4P31532 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Saa4P31532 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Saa4P31532 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.8 ms