Protein–RNA interactions for Protein: P23116

Eif3a, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif3aP23116 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
Eif3aP23116 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC25.94■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC25.93■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Eif3aP23116 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Eif3aP23116 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eif3aP23116 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eif3aP23116 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eif3aP23116 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eif3aP23116 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eif3aP23116 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Eif3aP23116 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms