Protein–RNA interactions for Protein: P22646

Cd3e, T-cell surface glycoprotein CD3 epsilon chain, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cd3eP22646 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
Cd3eP22646 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Cd3eP22646 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms