Protein–RNA interactions for Protein: P13346

Fosb, Protein fosB, mousemouse

Predictions only

Length 338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FosbP13346 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FosbP13346 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FosbP13346 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FosbP13346 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FosbP13346 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FosbP13346 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FosbP13346 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FosbP13346 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FosbP13346 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FosbP13346 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FosbP13346 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
FosbP13346 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FosbP13346 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FosbP13346 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FosbP13346 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FosbP13346 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FosbP13346 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FosbP13346 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FosbP13346 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FosbP13346 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FosbP13346 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FosbP13346 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FosbP13346 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FosbP13346 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
FosbP13346 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FosbP13346 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FosbP13346 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FosbP13346 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FosbP13346 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FosbP13346 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FosbP13346 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FosbP13346 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FosbP13346 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FosbP13346 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FosbP13346 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FosbP13346 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FosbP13346 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FosbP13346 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FosbP13346 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FosbP13346 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FosbP13346 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FosbP13346 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FosbP13346 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FosbP13346 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
FosbP13346 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FosbP13346 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FosbP13346 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FosbP13346 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FosbP13346 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FosbP13346 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FosbP13346 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FosbP13346 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FosbP13346 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FosbP13346 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FosbP13346 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FosbP13346 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FosbP13346 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FosbP13346 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FosbP13346 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
FosbP13346 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FosbP13346 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FosbP13346 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FosbP13346 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FosbP13346 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FosbP13346 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FosbP13346 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FosbP13346 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FosbP13346 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FosbP13346 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FosbP13346 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FosbP13346 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
FosbP13346 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FosbP13346 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FosbP13346 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FosbP13346 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FosbP13346 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FosbP13346 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FosbP13346 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FosbP13346 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FosbP13346 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FosbP13346 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FosbP13346 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FosbP13346 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FosbP13346 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FosbP13346 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FosbP13346 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FosbP13346 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FosbP13346 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FosbP13346 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FosbP13346 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FosbP13346 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
FosbP13346 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FosbP13346 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FosbP13346 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FosbP13346 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FosbP13346 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FosbP13346 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FosbP13346 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FosbP13346 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
FosbP13346 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms