Protein–RNA interactions for Protein: P0C0P8

Nps, Neuropeptide S, mousemouse

Predictions only

Length 89 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NpsP0C0P8 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
NpsP0C0P8 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
NpsP0C0P8 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
NpsP0C0P8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms