Protein–RNA interactions for Protein: O88466

Znf106, Zinc finger protein 106, mousemouse

Predictions only

Length 1,888 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf106O88466 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Znf106O88466 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf106O88466 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf106O88466 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
Znf106O88466 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf106O88466 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf106O88466 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf106O88466 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Znf106O88466 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Znf106O88466 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf106O88466 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf106O88466 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf106O88466 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf106O88466 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf106O88466 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Znf106O88466 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.6 ms