Protein–RNA interactions for Protein: O88343

Slc4a4, Electrogenic sodium bicarbonate cotransporter 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,079 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc4a4O88343 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Slc4a4O88343 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Slc4a4O88343 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Slc4a4O88343 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Slc4a4O88343 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.1 ms