Protein–RNA interactions for Protein: O88319

Ntsr1, Neurotensin receptor type 1, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ntsr1O88319 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ntsr1O88319 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ntsr1O88319 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntsr1O88319 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntsr1O88319 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntsr1O88319 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntsr1O88319 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntsr1O88319 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntsr1O88319 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntsr1O88319 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntsr1O88319 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntsr1O88319 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntsr1O88319 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntsr1O88319 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ntsr1O88319 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntsr1O88319 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ntsr1O88319 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms