Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Nptx2O70340 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Nptx2O70340 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nptx2O70340 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.6 ms