Protein–RNA interactions for Protein: O60609

GFRA3, GDNF family receptor alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 400 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFRA3O60609 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 ZNF74-204ENST00000405993 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 PNCK-204ENST00000370150 1612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 COMT-204ENST00000403710 1548 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 Z97986.1-201ENST00000565879 476 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
GFRA3O60609 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 KLC3-201ENST00000391946 1780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 TSPY20P-201ENST00000450910 630 ntBASIC23■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 HNRNPD-203ENST00000353341 1585 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 IL15RA-208ENST00000397251 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 IL15RA-221ENST00000620865 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GFRA3O60609 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms