Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Psmb5O55234 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Psmb5O55234 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Psmb5O55234 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms