Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PrxO55103 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PrxO55103 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PrxO55103 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PrxO55103 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PrxO55103 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PrxO55103 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PrxO55103 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PrxO55103 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PrxO55103 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PrxO55103 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PrxO55103 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PrxO55103 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PrxO55103 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PrxO55103 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PrxO55103 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PrxO55103 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PrxO55103 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PrxO55103 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PrxO55103 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PrxO55103 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PrxO55103 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC28.45■■■□□ 2.14
PrxO55103 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PrxO55103 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PrxO55103 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PrxO55103 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PrxO55103 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PrxO55103 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PrxO55103 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PrxO55103 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PrxO55103 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PrxO55103 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PrxO55103 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PrxO55103 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PrxO55103 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PrxO55103 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PrxO55103 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PrxO55103 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PrxO55103 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PrxO55103 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PrxO55103 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PrxO55103 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PrxO55103 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PrxO55103 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PrxO55103 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PrxO55103 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PrxO55103 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PrxO55103 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PrxO55103 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PrxO55103 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
PrxO55103 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PrxO55103 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PrxO55103 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.39■■■□□ 2.13
PrxO55103 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
PrxO55103 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PrxO55103 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PrxO55103 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PrxO55103 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PrxO55103 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PrxO55103 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PrxO55103 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PrxO55103 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PrxO55103 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PrxO55103 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PrxO55103 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PrxO55103 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PrxO55103 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PrxO55103 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PrxO55103 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PrxO55103 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PrxO55103 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PrxO55103 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PrxO55103 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PrxO55103 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PrxO55103 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PrxO55103 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PrxO55103 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
PrxO55103 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PrxO55103 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PrxO55103 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PrxO55103 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
PrxO55103 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PrxO55103 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PrxO55103 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PrxO55103 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PrxO55103 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PrxO55103 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PrxO55103 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PrxO55103 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PrxO55103 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PrxO55103 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PrxO55103 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PrxO55103 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PrxO55103 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
PrxO55103 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PrxO55103 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PrxO55103 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PrxO55103 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PrxO55103 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PrxO55103 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms