Protein–RNA interactions for Protein: O35738

Klf12, Krueppel-like factor 12, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klf12O35738 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf12O35738 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Klf12O35738 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf12O35738 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf12O35738 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Klf12O35738 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms