Protein–RNA interactions for Protein: O35638

Stag2, Cohesin subunit SA-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stag2O35638 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag2O35638 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stag2O35638 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stag2O35638 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stag2O35638 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Stag2O35638 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag2O35638 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag2O35638 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Stag2O35638 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stag2O35638 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Stag2O35638 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms