Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Edil3O35474 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Edil3O35474 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Edil3O35474 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Edil3O35474 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Edil3O35474 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Edil3O35474 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Edil3O35474 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Edil3O35474 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Edil3O35474 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms