Protein–RNA interactions for Protein: O08543

Efna5, Ephrin-A5, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Efna5O08543 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Efna5O08543 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna5O08543 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Efna5O08543 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efna5O08543 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Efna5O08543 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efna5O08543 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efna5O08543 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Efna5O08543 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efna5O08543 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efna5O08543 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Efna5O08543 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efna5O08543 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Efna5O08543 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efna5O08543 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efna5O08543 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Efna5O08543 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Efna5O08543 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms