Protein–RNA interactions for Protein: J3KMU4

Gm21060, Predicted gene, 21060, mousemouse

Predictions only

Length 56 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21060J3KMU4 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm21060J3KMU4 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Gm21060J3KMU4 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.3 ms