Protein–RNA interactions for Protein: F6VAN0

Atf6, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 alpha, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6F6VAN0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf6F6VAN0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf6F6VAN0 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf6F6VAN0 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf6F6VAN0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf6F6VAN0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf6F6VAN0 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf6F6VAN0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Atf6F6VAN0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf6F6VAN0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf6F6VAN0 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf6F6VAN0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf6F6VAN0 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf6F6VAN0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Atf6F6VAN0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Atf6F6VAN0 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Atf6F6VAN0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
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