Protein–RNA interactions for Protein: F6RSK3

Gm17430, Predicted gene, 17430, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17430F6RSK3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17430F6RSK3 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17430F6RSK3 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17430F6RSK3 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17430F6RSK3 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17430F6RSK3 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17430F6RSK3 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17430F6RSK3 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17430F6RSK3 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17430F6RSK3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17430F6RSK3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17430F6RSK3 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17430F6RSK3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17430F6RSK3 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17430F6RSK3 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17430F6RSK3 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17430F6RSK3 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Gm9817-201ENSMUST00000054395 2531 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Gm17430F6RSK3 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Gm17430F6RSK3 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms