Protein–RNA interactions for Protein: E9Q414

Apob, Apolipoprotein B-100, mousemouse

Predictions only

Length 4,505 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobE9Q414 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
ApobE9Q414 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
ApobE9Q414 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
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