Protein–RNA interactions for Protein: E9Q3J7

Gm3020, Predicted gene 3020, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3020E9Q3J7 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm3020E9Q3J7 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Gm3020E9Q3J7 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Gm3020E9Q3J7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms