Protein–RNA interactions for Protein: E9Q058

Gm3095, Predicted gene 3095, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3095E9Q058 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Gm3095E9Q058 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Pnrc1-201ENSMUST00000049357 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gm3095E9Q058 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gm3095E9Q058 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.4 ms