Protein–RNA interactions for Protein: E9PYQ0

Rsph10b, Radial spoke head 10 homolog B (Chlamydomonas), mousemouse

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph10bE9PYQ0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rsph10bE9PYQ0 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rsph10bE9PYQ0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rsph10bE9PYQ0 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 108.8 ms