Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.22□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.29
Vpreb3D3Z6J4 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vpreb3D3Z6J4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vpreb3D3Z6J4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.2 ms