Protein–RNA interactions for Protein: B2RUM3

AU015836, AU015836 protein, mousemouse

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AU015836B2RUM3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
AU015836B2RUM3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
AU015836B2RUM3 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
AU015836B2RUM3 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms