Protein–RNA interactions for Protein: B1AUH1

Ptpru, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, mousemouse

Predictions only

Length 1,446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtpruB1AUH1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
PtpruB1AUH1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC28.41■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
PtpruB1AUH1 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
PtpruB1AUH1 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
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