Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Odf2A3KGV1 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Odf2A3KGV1 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Odf2A3KGV1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms