Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z262

Cldn6, Claudin-6, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn6Q9Z262 Syde2-203ENSMUST00000200546 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Mrps26-202ENSMUST00000145614 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Brinp2-201ENSMUST00000004133 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Drg2-201ENSMUST00000018568 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 D630033O11Rik-204ENSMUST00000210588 1358 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Cldn6Q9Z262 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Cldn6Q9Z262 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 4833427G06Rik-201ENSMUST00000170947 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Cldn6Q9Z262 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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Cldn6Q9Z262 Usp5-202ENSMUST00000122110 3076 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Ldb3-201ENSMUST00000022327 5119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Slc29a1-209ENSMUST00000166119 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Cpeb1-201ENSMUST00000098331 3111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cldn6Q9Z262 Slc34a3-201ENSMUST00000006638 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Grm7-202ENSMUST00000172951 4197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Cyyr1-201ENSMUST00000114174 5464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Rab17-201ENSMUST00000027529 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Dlx5-202ENSMUST00000142635 1324 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cldn6Q9Z262 Limd2-201ENSMUST00000045923 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 2410002F23Rik-205ENSMUST00000107949 3610 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cldn6Q9Z262 Car10-201ENSMUST00000042943 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cldn6Q9Z262 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
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Cldn6Q9Z262 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Pex5-205ENSMUST00000112532 3148 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Spock3-202ENSMUST00000117377 3066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cldn6Q9Z262 Gm26799-201ENSMUST00000180959 1361 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Rnf113a2-201ENSMUST00000183146 1383 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Abhd1-202ENSMUST00000201125 1352 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Banp-210ENSMUST00000173254 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Cr1l-201ENSMUST00000075451 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Endou-201ENSMUST00000023105 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Matn2-203ENSMUST00000226766 3252 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Top2b-201ENSMUST00000017629 10335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cldn6Q9Z262 Calm1-202ENSMUST00000110082 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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