Protein–RNA interactions for Protein: Q9WTM3

Sema6c, Semaphorin-6C, mousemouse

Predictions only

Length 931 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sema6cQ9WTM3 Elf1-201ENSMUST00000040131 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Plagl1-201ENSMUST00000121325 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Brwd1-201ENSMUST00000023631 8209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Sgk3-202ENSMUST00000166384 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Pygo1-201ENSMUST00000038489 7916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Wdfy2-201ENSMUST00000014691 6646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Epm2aip1-201ENSMUST00000060711 7149 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Cog6-201ENSMUST00000036665 3182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Ggnbp1-202ENSMUST00000122106 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm44127-201ENSMUST00000203565 291 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 AC165260.3-202ENSMUST00000224550 1031 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Chrnb2-201ENSMUST00000029562 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Arhgef2-201ENSMUST00000029694 4300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Mdm4-201ENSMUST00000067398 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Dner-201ENSMUST00000049126 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Grid2ip-203ENSMUST00000120825 3865 ntTSL 5 BASIC11.81□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Bcl9l-201ENSMUST00000074989 5339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Wnt9b-201ENSMUST00000018630 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Ncoa7-201ENSMUST00000068567 5105 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Fam171a1-201ENSMUST00000062934 4129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Hist1h4b-201ENSMUST00000102965 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 1700042G07Rik-201ENSMUST00000106492 385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Aamdc-210ENSMUST00000146605 642 ntTSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Usp46os2-201ENSMUST00000152787 831 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm5637-201ENSMUST00000153890 1119 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm42902-201ENSMUST00000199508 662 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Krtap19-9a-201ENSMUST00000062005 168 ntAPPRIS P1 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Eprs-201ENSMUST00000046514 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Pxn-214ENSMUST00000212819 1689 ntTSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 2610037D02Rik-201ENSMUST00000180852 2449 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Cstf3-201ENSMUST00000028599 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Lmbr1-203ENSMUST00000196321 3422 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.8□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Fgd5-201ENSMUST00000089334 6095 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Lims1-202ENSMUST00000020078 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Ralgps2-207ENSMUST00000188656 2481 ntTSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Gm44579-201ENSMUST00000142443 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Mast4-207ENSMUST00000167058 10636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Rpe-202ENSMUST00000113995 2713 ntTSL 3 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 D730001G18Rik-202ENSMUST00000191407 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Sema6cQ9WTM3 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC11.79□□□□□ -0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms