Protein–RNA interactions for Protein: Q99741

CDC6, Cell division control protein 6 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 560 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC6Q99741 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 PLA1A-201ENST00000273371 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 AC008805.2-201ENST00000590069 435 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 ELOA3C-201ENST00000620688 1218 ntAPPRIS P1 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 SHISA5-210ENST00000444115 2081 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 PHLDB1-202ENST00000361417 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 TMEM256-201ENST00000302422 486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 MIR4722-201ENST00000578292 60 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 ZNRD1ASP-217ENST00000437417 1497 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 TRIML1-201ENST00000332517 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
CDC6Q99741 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms