Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 LDHAL6B-201ENST00000307144 1693 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 SERHL-201ENST00000359906 1346 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 HOXB1-201ENST00000239174 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 NACA-202ENST00000393891 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 LINC01868-201ENST00000414965 562 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 PSMA1-202ENST00000418988 1266 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 DCST1-AS1-201ENST00000452962 822 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 ALG1L6P-201ENST00000515248 758 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC145207.3-201ENST00000576784 529 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 HIST1H4I-201ENST00000615353 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AL024498.2-201ENST00000480294 1589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 TMEM177-202ENST00000401466 1346 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 SLC6A9-203ENST00000372306 1926 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 HLA-DQB2-232ENST00000437316 1214 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 LINC01783-202ENST00000614408 828 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 BX284668.2-205ENST00000619677 828 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 FO393412.1-201ENST00000619841 382 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC018629.1-201ENST00000623381 1736 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 UCN2-201ENST00000273610 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 MLLT3-210ENST00000630269 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 C8G-201ENST00000224181 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 RNA5SP359-201ENST00000364838 113 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 HDDC2-202ENST00000398153 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AL589843.1-201ENST00000423924 425 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AL512330.1-201ENST00000456701 349 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 PRKAB1-210ENST00000630317 258 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 PAK1IP1-201ENST00000379568 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 CEP128-201ENST00000216517 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 Z99943.1-201ENST00000451545 718 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 KLHDC8A-203ENST00000460687 1022 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 ALG1L13P-202ENST00000519320 584 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 NAPSB-201ENST00000525179 678 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AC003982.2-201ENST00000536933 365 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 C2orf69P1-201ENST00000563532 1093 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 AL118516.1-201ENST00000564152 670 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 RAN-210ENST00000541630 1475 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
TOPBP1Q92547 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms