Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZR4

Nek8, Serine/threonine-protein kinase Nek8, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek8Q91ZR4 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Duox2-201ENSMUST00000053734 5744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Tapbp-201ENSMUST00000025161 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.34
Nek8Q91ZR4 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Zfp108-201ENSMUST00000072713 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.9□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Prr12-201ENSMUST00000057293 7023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Hmbs-202ENSMUST00000097558 1534 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Specc1-213ENSMUST00000202179 6676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gm13293-201ENSMUST00000131188 1615 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 A730071L15Rik-201ENSMUST00000181545 1615 ntAPPRIS P1 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Sgk1-204ENSMUST00000120509 3096 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Hook2-204ENSMUST00000210326 3080 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Dnm3os-203ENSMUST00000185878 557 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Rpl10-202ENSMUST00000074085 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Usp3-211ENSMUST00000174387 1901 ntTSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Ankrd42-201ENSMUST00000056106 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Grik3-201ENSMUST00000030676 8973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Dgkz-203ENSMUST00000111303 4169 ntTSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Dip2a-201ENSMUST00000036033 6322 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.89□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Cngb1-203ENSMUST00000120044 3243 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Asphd2-201ENSMUST00000031291 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Ildr1-203ENSMUST00000119464 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Cdc7-201ENSMUST00000031221 2961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Lrrc57-203ENSMUST00000102498 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Grid2ip-201ENSMUST00000010969 3459 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Armcx2-203ENSMUST00000119010 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Grk4-202ENSMUST00000074651 3234 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Mthfsd-206ENSMUST00000133037 1060 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 BC025446-201ENSMUST00000055719 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Myo9b-202ENSMUST00000168839 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Cul9-204ENSMUST00000182485 7848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Apbb2-215ENSMUST00000162349 3362 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Apbb2-201ENSMUST00000087256 3362 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Sp4-201ENSMUST00000026367 5694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 E230029C05Rik-205ENSMUST00000208362 2444 ntTSL 2 BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 A730062M13Rik-201ENSMUST00000192843 1910 ntBASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Ric3-201ENSMUST00000055993 5281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Palld-204ENSMUST00000121785 6349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Rbp3-201ENSMUST00000035695 5295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Api5-201ENSMUST00000028617 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Nfe2l1-210ENSMUST00000167110 3547 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Slc4a3-202ENSMUST00000124341 7182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 2810407A14Rik-201ENSMUST00000069809 1699 ntTSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 CT025624.1-201ENSMUST00000224007 2700 ntBASIC12.87□□□□□ -0.35
Nek8Q91ZR4 Sstr5-201ENSMUST00000051864 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.87□□□□□ -0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.2 ms