Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Cyth3-202ENSMUST00000116456 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Btnl2-202ENSMUST00000178562 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Btnl2-201ENSMUST00000025198 2564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc18-204ENSMUST00000120951 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Mapk8ip3-202ENSMUST00000115228 5424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Rnf225-201ENSMUST00000045870 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ubxn4Q8VCH8 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Mfsd4a-207ENSMUST00000159038 1957 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Qpctl-201ENSMUST00000032566 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ddo-203ENSMUST00000213503 1759 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gng5-202ENSMUST00000118280 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Arvcf-204ENSMUST00000115613 4800 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rbm10-202ENSMUST00000082089 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 1110018N20Rik-202ENSMUST00000147446 1162 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Crb3-204ENSMUST00000163763 868 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ighv8-4-201ENSMUST00000178949 294 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm43240-201ENSMUST00000198543 630 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Hax1-207ENSMUST00000198782 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 1700029I15Rik-201ENSMUST00000054316 364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rpl10-ps2-201ENSMUST00000098432 645 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gpr19-203ENSMUST00000111932 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Slc33a1-201ENSMUST00000029402 3150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pbx1-205ENSMUST00000176540 6876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Mettl17-201ENSMUST00000047899 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tubd1-201ENSMUST00000020821 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ntrk2-202ENSMUST00000109838 6846 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rdh8-201ENSMUST00000066387 1405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pde6c-201ENSMUST00000025956 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Vps33b-201ENSMUST00000032749 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Arhgef3-204ENSMUST00000225949 3198 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Spata20-201ENSMUST00000041705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Npnt-203ENSMUST00000093971 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm2916-202ENSMUST00000181779 1702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Coa4-201ENSMUST00000054310 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ush1c-209ENSMUST00000222454 2580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 A830082K12Rik-201ENSMUST00000123998 2203 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Mad2l2-203ENSMUST00000105707 949 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm13612-201ENSMUST00000119276 390 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 1700092C10Rik-201ENSMUST00000172547 585 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Abhd18-205ENSMUST00000203472 588 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm8463-201ENSMUST00000208573 613 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Aprt-203ENSMUST00000211823 590 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm33460-201ENSMUST00000212286 536 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 AC155252.1-201ENSMUST00000226462 1208 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Olfr983-201ENSMUST00000050996 1050 ntTSL 2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm15823-201ENSMUST00000064305 670 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 n-R5s77-201ENSMUST00000083757 119 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Egr2-202ENSMUST00000105438 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm26703-201ENSMUST00000181370 2864 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Pi16-202ENSMUST00000114701 2756 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Traf7-201ENSMUST00000070777 2384 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gpld1-201ENSMUST00000021773 5224 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Tbx4-203ENSMUST00000108047 3153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Rwdd2a-201ENSMUST00000034988 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Mon1b-202ENSMUST00000179926 3470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Ttc23-202ENSMUST00000107470 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Myoc-201ENSMUST00000028020 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 Gm2231-201ENSMUST00000125661 612 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ubxn4Q8VCH8 1600025M17Rik-202ENSMUST00000151426 547 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms