Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCJ3

Ufl1, E3 UFM1-protein ligase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ufl1Q8CCJ3 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Tmem210-201ENSMUST00000028340 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Agrp-201ENSMUST00000005849 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Aire-202ENSMUST00000105395 1630 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Abcc6-201ENSMUST00000002850 4974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 D830024N08Rik-201ENSMUST00000212132 2899 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Tfap2c-202ENSMUST00000099058 2985 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Nrp2-204ENSMUST00000102822 6708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Nrp2-203ENSMUST00000075144 6723 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Mpp3-204ENSMUST00000107168 3094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ddx31-201ENSMUST00000113853 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Asb10-201ENSMUST00000048302 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Mcpt8-201ENSMUST00000015594 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm27552-201ENSMUST00000183351 62 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm27844-201ENSMUST00000183613 62 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm18227-201ENSMUST00000211082 1468 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Cldn15-201ENSMUST00000001790 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Tbx3-203ENSMUST00000121021 4777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Hdac5-203ENSMUST00000107151 4852 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 G2e3-201ENSMUST00000054308 6803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ankrd34b-201ENSMUST00000061594 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm5422-202ENSMUST00000216161 2928 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Cacna1b-203ENSMUST00000100348 7182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Cct5-201ENSMUST00000022842 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ufl1Q8CCJ3 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ufl1Q8CCJ3 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Pcdh8-201ENSMUST00000039568 4000 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Col20a1-205ENSMUST00000228434 5012 ntAPPRIS P2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Celf4-207ENSMUST00000225477 2626 ntAPPRIS P3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Ufl1Q8CCJ3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Pex3-201ENSMUST00000019945 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Tnfrsf21-201ENSMUST00000024708 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Cdk15-201ENSMUST00000114248 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Izumo1-201ENSMUST00000033100 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Pnp2-201ENSMUST00000095925 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm996-204ENSMUST00000191602 4812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Ccdc183-201ENSMUST00000028309 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Ufl1Q8CCJ3 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms