Protein–RNA interactions for Protein: Q6PD31

Trak1, Trafficking kinesin-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 939 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trak1Q6PD31 AC163354.1-205ENSMUST00000223262 1511 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Pnma3-201ENSMUST00000060418 3405 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Asap1-218ENSMUST00000177374 4582 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm14058-201ENSMUST00000116082 735 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Got2-ps1-201ENSMUST00000121655 1293 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm13944-201ENSMUST00000126572 721 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm5732-201ENSMUST00000182596 1007 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 4930578I06Rik-201ENSMUST00000022532 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Ntan1-201ENSMUST00000023362 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Rpl10a-201ENSMUST00000042334 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Hnrnph1-203ENSMUST00000109142 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Ascc3-201ENSMUST00000035606 7760 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Grm2-201ENSMUST00000023959 4711 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Ptpn9-201ENSMUST00000034832 4101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 D930032P07Rik-201ENSMUST00000181393 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Olfr139-204ENSMUST00000214111 1311 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Inpp5a-202ENSMUST00000097975 2301 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Prrt3-203ENSMUST00000204268 3741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Eif4g1-205ENSMUST00000115461 5507 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm23596-201ENSMUST00000104304 132 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Prdx1-202ENSMUST00000106470 877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Inca1-202ENSMUST00000108541 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gsto2-202ENSMUST00000120645 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Inca1-205ENSMUST00000126114 1189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 U2af1l4-234ENSMUST00000171850 564 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 H2-Q3-201ENSMUST00000172583 608 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 3110045C21Rik-201ENSMUST00000180638 1135 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm4607-201ENSMUST00000206649 577 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Lamb2-201ENSMUST00000065014 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Sntb1-201ENSMUST00000039769 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Kcnn2-205ENSMUST00000183850 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Hnrnpk-232ENSMUST00000225674 2704 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Lnx1-206ENSMUST00000121690 2302 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Kcnk2-202ENSMUST00000110920 3572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm12164-201ENSMUST00000121695 551 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm27184-201ENSMUST00000185095 607 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 8030455M16Rik-201ENSMUST00000213014 902 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 CT009718.3-201ENSMUST00000221116 367 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 AC154276.3-201ENSMUST00000227643 998 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Rpl24-201ENSMUST00000023269 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm42416-201ENSMUST00000115661 2856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Gm28719-201ENSMUST00000187779 1757 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Trak1Q6PD31 Zbtb44-205ENSMUST00000216649 3157 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trak1Q6PD31 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Trak1Q6PD31 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trak1Q6PD31 Fam49b-201ENSMUST00000063838 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trak1Q6PD31 Ntrk2-209ENSMUST00000225950 2640 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Trak1Q6PD31 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trak1Q6PD31 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trak1Q6PD31 Gm12915-201ENSMUST00000131381 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trak1Q6PD31 Spert-204ENSMUST00000169658 1474 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trak1Q6PD31 Cpne4-201ENSMUST00000057742 3959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Trak1Q6PD31 Ccdc92b-201ENSMUST00000100866 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms