Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCS8

Zbtb40, Zinc finger and BTB domain-containing 40, mousemouse

Predictions only

Length 1,258 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbtb40Q6PCS8 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 4930554G24Rik-201ENSMUST00000126260 1603 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Tectb-202ENSMUST00000120936 1349 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Thegl-201ENSMUST00000031161 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Slc12a8-206ENSMUST00000122427 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Atxn10-201ENSMUST00000163242 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Kcnip4-207ENSMUST00000176191 2116 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 5330413P13Rik-204ENSMUST00000210606 1464 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Bad-201ENSMUST00000025910 1451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Aifm3-201ENSMUST00000023448 2688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Gm29724-201ENSMUST00000214688 3062 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Zbtb40Q6PCS8 Anxa11-201ENSMUST00000022416 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Tbc1d5-205ENSMUST00000224528 4764 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Zfyve27-207ENSMUST00000169536 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Endov-202ENSMUST00000106244 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm42997-202ENSMUST00000200321 985 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
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Zbtb40Q6PCS8 1700012D14Rik-202ENSMUST00000209959 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Cotl1-203ENSMUST00000211873 826 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 AC153954.1-201ENSMUST00000216959 255 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Otx2-209ENSMUST00000226501 2592 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Abcg4-208ENSMUST00000161354 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Atxn2l-201ENSMUST00000040202 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Cd8b1-201ENSMUST00000065248 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Mcfd2-204ENSMUST00000144236 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gpatch4-203ENSMUST00000193398 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Luc7l-201ENSMUST00000025023 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Map6-205ENSMUST00000207883 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Wipf3-201ENSMUST00000126637 4414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Rbm14-201ENSMUST00000006625 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Zbtb40Q6PCS8 Gm43701-201ENSMUST00000202047 391 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Zbtb40Q6PCS8 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
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Zbtb40Q6PCS8 Hmga2-203ENSMUST00000159699 3810 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Ppp1r13l-201ENSMUST00000047621 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Zfp276-201ENSMUST00000001092 4071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Cldn18-202ENSMUST00000112882 1750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm44942-201ENSMUST00000096093 2072 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Parp10-202ENSMUST00000165738 3367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Nxf1-201ENSMUST00000010241 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Pde4dip-202ENSMUST00000090750 8376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Lmo3-202ENSMUST00000161450 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 9330159M07Rik-202ENSMUST00000180783 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm18711-201ENSMUST00000199341 750 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 4930504D19Rik-201ENSMUST00000204799 349 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Gm45765-201ENSMUST00000212027 1035 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Olfr1428-201ENSMUST00000087824 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Zbtb40Q6PCS8 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
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