Protein–RNA interactions for Protein: Q64487

Ptprd, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, mousemouse

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Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprdQ64487 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gucd1-201ENSMUST00000039796 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Plk2-201ENSMUST00000022212 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm12857-201ENSMUST00000117678 592 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm25881-201ENSMUST00000157783 103 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 1110002L01Rik-203ENSMUST00000179637 586 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Cfap52-201ENSMUST00000021287 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Dnmt3c-201ENSMUST00000119996 2223 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Slc24a4-201ENSMUST00000079020 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Zc3hc1-203ENSMUST00000115184 1504 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm7049-201ENSMUST00000223520 1712 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Irak1-203ENSMUST00000101458 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Espn-213ENSMUST00000105659 3595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm43677-201ENSMUST00000198098 2378 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Gm20633-201ENSMUST00000176742 2831 ntBASIC12.33□□□□□ -0.43
PtprdQ64487 Cadm3-202ENSMUST00000111220 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm7568-202ENSMUST00000160446 709 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Pcgf1-207ENSMUST00000177177 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 AC098716.1-201ENSMUST00000213527 703 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm9797-202ENSMUST00000218003 294 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 AC154849.4-201ENSMUST00000224868 365 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm10152-201ENSMUST00000193475 1344 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Ccr4-202ENSMUST00000215425 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Rnh1-202ENSMUST00000167493 1656 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Hcls1-201ENSMUST00000023531 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Irf1-202ENSMUST00000108920 2137 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 3200001D21Rik-201ENSMUST00000221603 2283 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Ggn-202ENSMUST00000098609 2653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Lrfn3-201ENSMUST00000046351 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Zbtb20-205ENSMUST00000114695 2977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Slc13a5-201ENSMUST00000021161 3329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Meioc-201ENSMUST00000100378 4573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Arrdc4-201ENSMUST00000048068 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Ate1-201ENSMUST00000033139 4735 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Mapkapk5-204ENSMUST00000111783 1513 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
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PtprdQ64487 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gdf6-201ENSMUST00000057613 3532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Ccdc88c-202ENSMUST00000085096 6313 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gpr35-205ENSMUST00000186298 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Dnmt3b-205ENSMUST00000103150 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Oasl1-201ENSMUST00000031540 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 4931429P17Rik-201ENSMUST00000061899 2012 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Wnt9a-201ENSMUST00000000128 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Slc35f6-205ENSMUST00000196740 1972 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Eln-201ENSMUST00000015138 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm36855-203ENSMUST00000216660 1406 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Rtbdn-204ENSMUST00000152378 2322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Tubb4a-201ENSMUST00000071135 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm23912-201ENSMUST00000104687 87 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Timm22-202ENSMUST00000120699 746 ntTSL 3 BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 1700001G11Rik-203ENSMUST00000153646 764 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 5430405H02Rik-202ENSMUST00000176134 1196 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm8956-201ENSMUST00000203939 825 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gm10069-203ENSMUST00000204081 907 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
PtprdQ64487 Smarca1-205ENSMUST00000141084 1965 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms