Protein–RNA interactions for Protein: P11477

Defa1, Alpha-defensin 1, mousemouse

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa1P11477 Ccdc121-201ENSMUST00000058825 1819 ntAPPRIS P1 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Nrg1-201ENSMUST00000073884 2452 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Haus8-202ENSMUST00000110071 1452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Tns1-217ENSMUST00000191104 9904 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gpatch2l-204ENSMUST00000221368 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Ctnnbl1-201ENSMUST00000029178 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC8.89□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm28539-201ENSMUST00000190050 2982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm37600-201ENSMUST00000193764 3292 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Rnf180-205ENSMUST00000226044 3279 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Hadhb-203ENSMUST00000114786 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Kif1a-204ENSMUST00000171796 8206 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm37513-201ENSMUST00000194830 2268 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm38378-201ENSMUST00000195153 2268 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Podn-201ENSMUST00000044248 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Mfsd7a-201ENSMUST00000031455 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Naaa-202ENSMUST00000159345 1629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Armcx2-201ENSMUST00000035559 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Dip2c-201ENSMUST00000166299 4822 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Lrrc34-201ENSMUST00000029252 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Palm-204ENSMUST00000218631 2725 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Eaf2-204ENSMUST00000114829 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Tnni1-205ENSMUST00000148201 1150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Tnni1-206ENSMUST00000152075 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Tnni1-207ENSMUST00000152208 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Far2os1-201ENSMUST00000162391 555 ntTSL 2 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm2495-201ENSMUST00000191160 466 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 4933435G04Rik-201ENSMUST00000205892 2108 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Coprs-202ENSMUST00000209371 601 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Ap2s1-201ENSMUST00000086112 836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Fbxl20-201ENSMUST00000103143 8601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Inpp4b-215ENSMUST00000217122 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gtf3c5-202ENSMUST00000113889 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Psap-204ENSMUST00000177779 2657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Psap-205ENSMUST00000179238 2657 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Vmn1r65-201ENSMUST00000086338 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Erbb3-201ENSMUST00000082059 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm17746-201ENSMUST00000223429 3772 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm3294-201ENSMUST00000164104 7367 ntTSL 3 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Smarca2-201ENSMUST00000025862 5921 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Srrm4-201ENSMUST00000076124 7472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm35721-201ENSMUST00000220294 2014 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Micu1-202ENSMUST00000092508 2294 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm15222-202ENSMUST00000228667 1726 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Frmd4a-216ENSMUST00000176828 4355 ntTSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Zfp687-201ENSMUST00000019482 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Son-204ENSMUST00000119368 7529 ntTSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Mrpl44-201ENSMUST00000027464 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Entpd2-201ENSMUST00000028328 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Kcna10-201ENSMUST00000055064 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.88□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Alx1-203ENSMUST00000167156 2689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Pde1c-201ENSMUST00000044505 3907 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Creb3-201ENSMUST00000102944 1884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Ces1h-201ENSMUST00000145041 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Retsat-205ENSMUST00000176364 1647 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Arl14ep-201ENSMUST00000028536 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Pask-201ENSMUST00000027493 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Nxph1-202ENSMUST00000160300 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Arfgap1-203ENSMUST00000108860 2326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Ppp2r2b-203ENSMUST00000120632 2081 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Adamts10-201ENSMUST00000087623 4043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Zbtb25-205ENSMUST00000176509 1591 ntTSL 2 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Prpf40b-208ENSMUST00000136980 3047 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Kir3dl1-202ENSMUST00000113105 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Dlk2-201ENSMUST00000061722 1532 ntTSL 5 BASIC8.87□□□□□ -0.99
Defa1P11477 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.87□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.1 ms