Protein–RNA interactions for Protein: O08788

Dctn1, Dynactin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn1O08788 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Inca1-201ENSMUST00000073625 1218 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Chrdl1-203ENSMUST00000112878 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Fut9-202ENSMUST00000108199 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Cnot3-201ENSMUST00000038913 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 AL670603.1-201ENSMUST00000216692 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Pou2f2-203ENSMUST00000108415 7095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Evx1os-201ENSMUST00000125305 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Ttc3-202ENSMUST00000119131 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Galnt6-201ENSMUST00000052069 3798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Kcnk13-204ENSMUST00000177549 3075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Hoxd3os1-202ENSMUST00000139005 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Ablim2-209ENSMUST00000129347 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Arhgap27os3-201ENSMUST00000124462 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Alx4-202ENSMUST00000111254 7056 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gm11924-201ENSMUST00000152306 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gm15432-201ENSMUST00000121106 195 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 1700119H24Rik-201ENSMUST00000187558 588 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Azgp1-201ENSMUST00000035390 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Vars-201ENSMUST00000087315 4137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Tspan32-201ENSMUST00000009396 1582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Tead3-207ENSMUST00000219703 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gm9918-201ENSMUST00000181801 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Plekhb1-204ENSMUST00000107045 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Ttc33-203ENSMUST00000118193 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Specc1-209ENSMUST00000201671 2523 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Slc25a45-206ENSMUST00000155697 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Scp2-201ENSMUST00000030340 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Asap1-217ENSMUST00000177371 6164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Ncor2-204ENSMUST00000111394 7452 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Mettl14-201ENSMUST00000029759 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gm1661-203ENSMUST00000165128 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Klhdc7b-201ENSMUST00000166926 1818 ntAPPRIS P2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Zfhx2os-202ENSMUST00000183750 4375 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Nkx6-3-201ENSMUST00000071588 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gm13035-201ENSMUST00000117496 342 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Mcfd2-205ENSMUST00000145895 751 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Smpd4-223ENSMUST00000172182 516 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gm43962-201ENSMUST00000203898 190 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gm2511-202ENSMUST00000206158 455 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Timm9-201ENSMUST00000021486 794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gm10176-201ENSMUST00000159707 2264 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Col26a1-201ENSMUST00000057497 2724 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Eme1-201ENSMUST00000039949 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Trappc9-203ENSMUST00000168191 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Zer1-202ENSMUST00000113677 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Hps1-208ENSMUST00000162004 2847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Cd79b-201ENSMUST00000044228 1431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Gpc2-205ENSMUST00000161827 2586 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Scarb2-201ENSMUST00000031377 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Tmem220-201ENSMUST00000061786 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Dctn1O08788 Mecom-206ENSMUST00000172694 4381 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn1O08788 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn1O08788 Zbtb1-201ENSMUST00000042779 12190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn1O08788 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn1O08788 Ly9-202ENSMUST00000068878 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn1O08788 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Dctn1O08788 Smc6-208ENSMUST00000218866 3373 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.1 ms