Protein–RNA interactions for Protein: A3KG45

Gm6880, MCG1035527 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 208 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6880A3KG45 Dync1i2-202ENSMUST00000100028 2097 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 F830115B05Rik-201ENSMUST00000197638 1894 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Hoxd3-202ENSMUST00000111982 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Dhx58-201ENSMUST00000017974 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ighg2c-201ENSMUST00000103416 1214 ntAPPRIS P5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Folr1-201ENSMUST00000106981 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Folr1-202ENSMUST00000106982 1039 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm15711-201ENSMUST00000118889 535 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 3110056K07Rik-202ENSMUST00000136690 1063 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Tmem116-209ENSMUST00000156080 1184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Smim22-207ENSMUST00000184439 382 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm46400-201ENSMUST00000222294 724 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 AC159205.5-202ENSMUST00000224849 386 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 AC163667.3-201ENSMUST00000225774 222 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm14267-206ENSMUST00000226870 1209 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Hapln4-201ENSMUST00000007738 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Nkain3-201ENSMUST00000102998 3098 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm13305-201ENSMUST00000098121 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Rp2-201ENSMUST00000033372 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Il6ra-201ENSMUST00000029559 3343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ccdc125-201ENSMUST00000057325 2413 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Fbxl19-202ENSMUST00000186116 3641 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ap2a1-204ENSMUST00000167930 3376 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Oraov1-201ENSMUST00000033388 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Thnsl2-201ENSMUST00000074241 1821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm17518-201ENSMUST00000181232 1346 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ralgps2-214ENSMUST00000191605 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Cipc-211ENSMUST00000191463 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Kcnk16-202ENSMUST00000225596 2127 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm20683-201ENSMUST00000176751 2790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Tmx2-203ENSMUST00000111665 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Stat3-203ENSMUST00000127638 4516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Rtn4rl1-201ENSMUST00000102514 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 n-R5s14-201ENSMUST00000122688 107 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm12348-201ENSMUST00000138915 313 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm16172-201ENSMUST00000156224 682 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm21057-202ENSMUST00000206111 512 ntTSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm45118-201ENSMUST00000208928 825 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 S100a1-201ENSMUST00000060738 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Apc-201ENSMUST00000066133 1185 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Hist1h3a-201ENSMUST00000091701 534 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Ctif-201ENSMUST00000165559 6173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Mtnr1a-201ENSMUST00000067984 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Adat3-201ENSMUST00000178231 4516 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Gm10305-201ENSMUST00000195331 2475 ntBASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Phactr3-201ENSMUST00000103065 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Pqlc2-202ENSMUST00000105801 2756 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Pnkd-203ENSMUST00000087226 3054 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Gm6880A3KG45 Trappc2l-201ENSMUST00000015157 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm26777-201ENSMUST00000181852 2573 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Smim13-201ENSMUST00000165561 4483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Chfr-201ENSMUST00000014812 3146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Ptpn14-201ENSMUST00000027898 2666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 BC027072-201ENSMUST00000057405 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gm13187-202ENSMUST00000133873 1321 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Nfkb1-206ENSMUST00000164430 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Gabrg3-201ENSMUST00000068394 1724 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Plcd1-203ENSMUST00000214470 2706 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Eif4enif1-202ENSMUST00000110048 3712 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Phldb1-213ENSMUST00000144251 3589 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Gm6880A3KG45 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76 ms