Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPQ4

TRIM35, Tripartite motif-containing protein 35, humanhuman

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Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM35Q9UPQ4 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 DUSP18-201ENST00000334679 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 ALG5-201ENST00000239891 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC092933.1-201ENST00000393644 945 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC068228.2-201ENST00000522383 777 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 OR4C6-202ENST00000641251 1058 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
TRIM35Q9UPQ4 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 HTR3A-203ENST00000375498 2235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 MAP1LC3B-201ENST00000268607 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 CCDC155-201ENST00000447857 2378 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 HIST2H2BA-202ENST00000430394 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
TRIM35Q9UPQ4 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
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