Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9Z2

LIN28A, Protein lin-28 homolog A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LIN28AQ9H9Z2 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 HNRNPH1-201ENST00000329433 2114 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 FAM220BP-201ENST00000377689 816 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 NRSN2-210ENST00000621012 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 AC010327.5-201ENST00000586923 3061 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 RAPGEF4-201ENST00000397081 4299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ZKSCAN7-201ENST00000273320 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
LIN28AQ9H9Z2 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 TMBIM4-202ENST00000358230 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 PML-208ENST00000436891 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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LIN28AQ9H9Z2 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
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LIN28AQ9H9Z2 C2orf88-205ENST00000443551 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 SIPA1-203ENST00000527525 3235 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 CBX7-201ENST00000216133 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC15.07■□□□□ 0
LIN28AQ9H9Z2 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
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