Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 KRTAP10-13P-201ENST00000412914 571 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC080129.2-201ENST00000418353 430 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AL157902.1-202ENST00000425010 763 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AL451065.1-201ENST00000428958 238 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC091804.1-201ENST00000486888 567 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CCL5-202ENST00000605140 1244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AL021578.1-201ENST00000613646 709 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 LY9-204ENST00000368039 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 BAP1-202ENST00000460680 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ERH-203ENST00000557016 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PRCD-210ENST00000592014 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 LINC01233-203ENST00000601708 494 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ADGRA1-202ENST00000392607 4283 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ZSCAN32-205ENST00000439568 1746 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC018735.1-201ENST00000437208 1502 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
NPAS3Q8IXF0 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms