Protein–RNA interactions for Protein: Q8C1M2

Znf428, Zinc finger protein 428, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf428Q8C1M2 Gm10288-201ENSMUST00000084614 537 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Znf428Q8C1M2 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Znf428Q8C1M2 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Znf428Q8C1M2 Mau2-201ENSMUST00000050561 5369 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Ist1-201ENSMUST00000034164 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Znf428Q8C1M2 Pdik1l-201ENSMUST00000061234 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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Znf428Q8C1M2 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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Znf428Q8C1M2 Ccdc88c-201ENSMUST00000068411 7542 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Ap1s2-201ENSMUST00000033734 1785 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Ddx24-202ENSMUST00000110001 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Lpcat1-208ENSMUST00000223060 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Sept4-203ENSMUST00000107960 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Myl6-202ENSMUST00000217733 1668 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Lmbr1l-202ENSMUST00000109127 2548 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Pcsk7-201ENSMUST00000039059 3876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Auts2-208ENSMUST00000161374 4216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gapvd1-202ENSMUST00000102800 8339 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Vopp1-202ENSMUST00000127485 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Map3k12-201ENSMUST00000023812 5182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Gpr137b-202ENSMUST00000220628 3634 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Lmntd2-202ENSMUST00000170841 2077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Zmym3-205ENSMUST00000119699 1750 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Tbc1d16-201ENSMUST00000036113 6986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Ssh1-204ENSMUST00000159592 8436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Znf428Q8C1M2 Slc35c2-202ENSMUST00000109298 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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