Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUY9

Pggt1b, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pggt1bQ8BUY9 Tspan14-201ENSMUST00000047652 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gtf2f1-201ENSMUST00000002733 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Stox2-201ENSMUST00000079195 10467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm8793-201ENSMUST00000183069 1303 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm5620-201ENSMUST00000077991 1348 ntBASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Trf-203ENSMUST00000112645 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Nbeal2-210ENSMUST00000167320 8803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 P4ha1-203ENSMUST00000105466 2918 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Spag9-202ENSMUST00000041956 7340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Med28-205ENSMUST00000156481 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ggt1-201ENSMUST00000006508 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm17276-201ENSMUST00000180839 2782 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Cdkn1a-202ENSMUST00000119901 748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Dgcr6-203ENSMUST00000143343 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm7809-201ENSMUST00000153199 742 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm8738-201ENSMUST00000172606 329 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm8835-201ENSMUST00000173096 1169 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm38230-201ENSMUST00000193572 1159 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Chfr-212ENSMUST00000200038 606 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tmem176b-206ENSMUST00000203355 1202 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tgif2-ps1-201ENSMUST00000203590 713 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 AC108416.1-202ENSMUST00000228927 1201 ntBASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 B230398E01Rik-201ENSMUST00000125186 1958 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Adck2-204ENSMUST00000140364 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Cercam-201ENSMUST00000047521 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Lhx6-201ENSMUST00000112960 3345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm2885-201ENSMUST00000181895 1442 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm44929-202ENSMUST00000209134 1653 ntTSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Snx6-201ENSMUST00000005798 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tnn-202ENSMUST00000131919 3987 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Fam126a-203ENSMUST00000115109 2195 ntTSL 5 BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tspan2-201ENSMUST00000029451 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Pmp22-204ENSMUST00000108702 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Iba57-201ENSMUST00000054523 4021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Wdr20rt-201ENSMUST00000046331 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Slc22a15-201ENSMUST00000106928 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Timm10b-202ENSMUST00000106780 671 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Unc50-202ENSMUST00000114925 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm4984-201ENSMUST00000115987 360 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Cox6c-203ENSMUST00000153512 738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Psme1-202ENSMUST00000172738 681 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Mt3-203ENSMUST00000211930 477 ntTSL 2 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
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Pggt1bQ8BUY9 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Olfr521-201ENSMUST00000098263 967 ntAPPRIS P1 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Lrp8-206ENSMUST00000126573 2590 ntTSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Slc25a22-203ENSMUST00000106007 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Prkce-202ENSMUST00000097275 6254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Pacrg-201ENSMUST00000041463 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.34□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Kcp-203ENSMUST00000101614 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Lnx1-204ENSMUST00000117388 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.43
Pggt1bQ8BUY9 Tor3a-201ENSMUST00000079625 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Tfcp2-201ENSMUST00000009877 3250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Pros1-201ENSMUST00000023629 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Hbs1l-201ENSMUST00000020153 2793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Wasf2-202ENSMUST00000105912 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Lsp1-201ENSMUST00000018963 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 5830462O15Rik-201ENSMUST00000214603 1655 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Gm9431-201ENSMUST00000119765 1051 ntBASIC12.33□□□□□ -0.44
Pggt1bQ8BUY9 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.33□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.6 ms